RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	DDB2	Q92466	427 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CCL3L1	P16619	93 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	RAB4B	P61018	213 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	COTL1	Q14019	142 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	VSIR	Q9H7M9	311 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	RAB29	O14966	203 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	SFTA3	P0C7M3	94 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CASP6	P55212	293 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	ACACB	O00763	2458 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TAS2R30	P59541	319 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	DEFA6	Q01524	100 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	NEU1	Q99519	415 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	FLNC	Q14315	2725 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CHRNB4	P30926	498 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	NPBWR1	P48145	328 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	RAB5C	P51148	216 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CORO2A	Q92828	525 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	RARRES2	Q99969	163 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TLE3-213	ENST00000558379	HPRT1	P00492	218 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	CD3E	P07766	207 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	PPT1	P50897	306 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	GUK1	Q16774	197 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	DFFB	O76075	338 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	MYOD1	P15172	320 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	PFDN5	Q99471	154 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	S1PR3	Q99500	378 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	IFNA5	P01569	189 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	SVBP	Q8N300	66 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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