RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RRH	O14718	337 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	FGF16	O43320	207 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC25A17	O43808	307 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR137B	O60478	399 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	PRAF2	O60831	178 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SFT2D2	O95562	160 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	KRAS	P01116	189 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	DHRS2	Q13268	280 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	LYG2	Q86SG7	212 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	LGI3	Q8N145	548 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	PHB2	Q99623	299 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	ESM1	Q9NQ30	184 aa		10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	C9orf170	A2RU37	121 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	CHST1	O43916	411 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	CDS2	O95674	445 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	F2RL1	P55085	397 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	UBE2K	P61086	200 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	PSG5	Q15238	335 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF585B	Q52M93	769 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SSX9	Q7RTT3	188 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	NPB	Q8NG41	125 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	IL22RA2	Q969J5	263 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	ACTL6B	O94805	426 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2A4	O95047	310 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	NDUFA3	O95167	84 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	CNTFR	P26992	372 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	G6PC	P35575	357 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM187	Q14656	261 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4A47	Q6IF82	309 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	LIN54	Q6MZP7	749 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	TEX45	Q8NA69	505 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4A5	Q8NH83	315 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RITA1	Q96K30	269 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM56	Q96MV1	263 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2A7	Q96R45	310 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	FBXL15	Q9H469	300 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM140	Q9NV12	185 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A0B4J2A0	478 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SNAPC5	O75971	98 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	KBTBD11	O94819	623 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	IGLV2-23	P01705	113 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	IL5	P05113	134 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SPN	P16150	400 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	OXA1L	Q15070	435 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	POU2AF1	Q16633	256 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	FBLN7	Q53RD9	439 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM219A	Q8IW50	185 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC35G3	Q8N808	338 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904		Q8N9W7	124 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ABCD4-223	ENST00000555904	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
ABCD4-223	ENST00000555904	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		9.96	□□□□□ -0.82
ABCD4-223	ENST00000555904	IFNA21	P01568	189 aa		9.96	□□□□□ -0.82
ABCD4-223	ENST00000555904	HLA-DRB1	P01911	266 aa		9.96	□□□□□ -0.82
ABCD4-223	ENST00000555904	VDAC1	P21796	283 aa		9.96	□□□□□ -0.82
ABCD4-223	ENST00000555904	GNB1	P62873	340 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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