RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TMEM11P17152 192 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MAS1LP35410 378 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 IER3P46695 156 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 AKR1C2P52895 323 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 UBE2KP61086 200 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZNF585BQ52M93 769 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 NPBQ8NG41 125 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 R3HDM4Q96D70 268 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RHOVQ96L33 236 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 HARBI1Q96MB7 349 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 BEX1Q9HBH7 125 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 COA4Q9NYJ1 87 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 BET1LQ9NYM9 111 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ALG5Q9Y673 324 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GU03 582 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DBX1A6NMT0 343 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CLDN34H7C241 214 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 NBR2O15453 112 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FGF16O43320 207 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RAMP3O60896 148 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR2F2O95006 317 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR2A4O95047 310 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 KRASP01116 189 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 IGKV1-16P04430 117 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SP6Q3SY56 376 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SEC22AQ96IW7 307 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR2A7Q96R45 310 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRNDQ9UKY0 176 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TCF19Q9Y242 345 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 HIVEP1P15822 2718 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 H3BUX3 64 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ACTL6BO94805 426 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 S1PR2O95136 353 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 NDUFA3O95167 84 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FAM157CP0CG43 387 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRR20EP86478 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRR20CP86479 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRR20DP86480 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRR20BP86481 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PRR20AP86496 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MMDQ15546 238 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MMD2Q8IY49 270 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 Q8N6K4 173 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SLC35G3Q8N808 338 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 OR4A16Q8NH70 328 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C17orf50Q8WW18 174 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 GPHA2Q96T91 129 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 F8P00451 2351 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 A6NDX4 124 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 HMX3A6NHT5 357 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 RRHO14718 337 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 CRLF1O75462 422 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 MED6O75586 246 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 KBTBD11O94819 623 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 G6PCP35575 357 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 SMCO1Q147U7 214 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PLGLAQ15195 96 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PSG5Q15238 335 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR4A47Q6IF82 309 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 ZNF429Q86V71 674 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-220ENST00000550700 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms