RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SPTSSAQ969W0 71 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ISOC2Q96AB3 205 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 IP6K3Q96PC2 410 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RASL10BQ96S79 203 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NIT2Q9NQR4 276 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TREM2Q9NZC2 230 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MIOXQ9UGB7 285 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FREM3P0C091 2139 aa3.28□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR5H15A6NDH6 313 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF724A8MTY0 619 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 B4DEV8 164 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 H0Y980 276 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TP53I11O14683 189 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HSD17B6O14756 317 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DIRAS3O95661 229 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PPYP01298 95 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IFNA10P01566 189 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-12P01611 117 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A6P12236 298 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NQO2P16083 231 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CBR1P16152 277 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GABRR1P24046 479 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V0CP27449 155 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 AKR1C3P42330 323 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FHITP49789 147 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MTCP1P56278 107 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RAB2AP61019 212 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IL24Q13007 206 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GNMTQ14749 295 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ELOBQ15370 118 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KHDC3LQ587J8 217 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PYY3Q5JQD4 70 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CARD17Q5XLA6 110 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OSR2Q8N2R0 312 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SLC35G3Q8N808 338 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RAB39BQ96DA2 213 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 REEP6Q96HR9 211 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TP53RKQ96S44 253 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ATP5SQ99766 215 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GGACTQ9BVM4 153 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.27□□□□□ -1.89
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SGCE-211ENST00000522045 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GLRX2Q9NS18 164 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GPR173Q9NS66 373 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 F5P12259 2224 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LRP5LA4QPB2 252 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF716A6NP11 495 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 F5H5K5 113 aa3.26□□□□□ -1.89
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