RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	WNT9B	O14905	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SOX15	O60248	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	YPEL1	O60688	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GOSR1	O95249	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PAX6	P26367	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPR12	P47775	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ASCL1	P50553	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPT1	P50897	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB7A	P51149	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PAX9	P55771	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	UBE2K	P61086	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RHEB	Q15382	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	COQ2	Q96H96	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		Q9UFV3	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	MLX	Q9UH92	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ODAM	A1E959	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		A8MXE2	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF737	O75373	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM50A	O95807	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HPRT1	P00492	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LHB	P01229	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNA1	P01562	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	MB	P02144	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IAPP	P10997	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	IRF2	P14316	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PTAFR	P25105	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GLIPR1	P48060	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPBWR1	P48145	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ERVK-16	P61578	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		Q5PR19	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808		Q6ZRM9	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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