RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.14□□□□□ -1.43
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SEC31A-241ENST00000515749 A8MXK9 166 aa6.13□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 IGLV1-47P01700 117 aa6.13□□□□□ -1.43
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SEC31A-241ENST00000515749 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 ATP6V1G1O75348 118 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 LY6HO94772 140 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 CRYZL1O95825 349 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 SEC11BP0C7V7 166 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 CEACAM3P40198 252 aa6.11□□□□□ -1.43
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SEC31A-241ENST00000515749 PAX9P55771 341 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 ATP6V1FQ16864 119 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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