RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MPPED1O15442 326 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV2-14P01704 120 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR9G9P0C7N8 305 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARPC4P59998 168 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MSMO1Q15800 293 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOGA1Q86XE5 327 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4S2Q8NH73 311 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SORL1Q92673 2214 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPNP16150 400 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBX5P45973 191 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TATDN3Q17R31 274 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFSD4AQ8N468 514 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 U3KQK5 164 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A087WXM4 84 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM223BA6NKX1 122 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2A4O95047 310 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GP9P14770 177 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCGR2CP31995 323 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIR2DS2P43631 304 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DYRK1AQ13627 763 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNAPC3Q92966 411 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2A7Q96R45 310 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XRCC3O43542 346 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AIREO43918 545 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HRASP01112 189 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV1-51P01701 117 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APELAP0DMC3 54 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAS1LP35410 378 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM209BQ5JX69 171 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TENM3Q9P273 2699 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KBTBD11O94819 623 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNFAIP8O95379 198 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPYP01298 95 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHOGP84095 191 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP5G2Q06055 141 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NECAP1Q8NC96 275 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNCP24821 2201 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H0Y980 276 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS19P39019 145 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNJ2BPP57105 145 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPEL1Q2QD12 228 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BORCS5Q969J3 196 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YIPF6Q96EC8 236 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASCL2Q99929 193 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CATR1Q13166 79 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4A5Q8NH83 315 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFT46Q9NQC8 304 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPPA5A6NC42 116 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms