RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508		M0R1X1	148 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TOR1A	O14656	332 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC31A2	O15432	143 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFB3	O43676	98 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	PROP1	O75360	226 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	NXPH3	O95157	252 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	KIR2DS2	P43631	304 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	LCN2	P80188	198 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508		B4DSR2	109 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SYNGR2	O43760	224 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	FGF2	P09038	288 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	G6PC	P35575	357 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SULT1A2	P50226	295 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TAS2R30	P59541	319 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	C1orf159	Q96HA4	380 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508		A8MXK9	166 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TXNL1	O43396	289 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MED6	O75586	246 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	FSTL3	O95633	263 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	KRAS	P01116	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MSMB	P08118	114 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	NFYB	P25208	207 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MIDN	Q504T8	468 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	FCN3	O75636	299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	HPRT1	P00492	218 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF266	Q14584	549 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF273	Q14593	569 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	UTF1	Q5T230	341 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	STX12	Q86Y82	276 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	FCGR3B	O75015	233 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	FBXO24	O75426	580 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MMP23A	O75900	390 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	THBS3	P49746	956 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SULT1A1	P50225	295 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	DYNLT3	P51808	116 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00205	P59089	165 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	DVL1	O14640	695 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	CST7	O76096	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SPP1	P10451	314 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	IAPP	P10997	89 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	DDB2	Q92466	427 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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