RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 HIST3H3Q16695 136 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 V9GYV3 84 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PQU0 124 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 S100GP29377 79 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 Q8N7P7 452 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ATP6V0BQ99437 205 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.18□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 H3BUT2 72 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RAMP3O60896 148 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DHRS3O75911 302 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CST6Q15828 149 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FAM168AQ92567 244 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RAB37Q96AX2 223 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR8B2Q96RD0 313 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RAB40CQ96S21 281 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 THADAQ6YHU6 1953 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PNR3 127 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR4C46A6NHA9 309 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 A6NJY4 79 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 M0R2Z0 102 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 DLL1O00548 723 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CLDN1O95832 211 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TNFP01375 233 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 F2RP25116 425 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MC5RP33032 325 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 EDDM3BP56851 147 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HTD2P86397 168 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TBR1Q16650 682 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 VWC2Q2TAL6 325 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.17□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 USF3Q68DE3 2245 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MT-CO3P00414 261 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV3-1P01715 115 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PTGDSP41222 190 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CLRN1P58418 232 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ARF6P62330 175 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PRSS38A1L453 326 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 FOXH1O75593 365 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV2-14P01704 120 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 PATE4P0C8F1 98 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2G1P62253 170 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 NRN1LQ496H8 165 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 TCF24Q7RTU0 167 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 OSR2Q8N2R0 312 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
VWA3B-220ENST00000495571 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms