RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GZMBP10144 247 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CCL3P10147 92 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 FHAD1B1AJZ9 1412 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 UNC13BO14795 1591 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM235A6NFC5 223 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM23A6NLE4 172 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 OR11H12B2RN74 326 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 GABRA4P48169 554 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 OR11H2Q8NH07 326 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MYOM1P52179 1685 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 NEO1Q92859 1461 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 RPS12P25398 132 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 LPCAT4Q643R3 524 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 PTH2Q96A98 100 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 STACQ99469 402 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CCL26Q9Y258 94 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DLC1Q96QB1 1528 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 WIZO95785 1651 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 OR5K4A6NMS3 321 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DISC1C4P0D8 188 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DCTN3O75935 186 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 APOMO95445 188 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-69P01742 117 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINB10P48595 397 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 GNA12Q03113 381 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 RSU1Q15404 277 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf195Q5TG92 126 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 SBSNQ6UWP8 590 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 KIF15Q9NS87 1388 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 PCNTO95613 3336 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 UCHL3P15374 230 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TBPL1P62380 186 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DAND5Q8N907 189 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 OPTNQ96CV9 577 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-212ENST00000491302 DSCAMO60469 2012 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CALB1P05937 261 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R30P59541 319 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-1P60331 282 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 FOXF1Q12946 379 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CCL13Q99616 98 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 IQGAP1P46940 1657 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 HECW1Q76N89 1606 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 KNCNA6PVL3 124 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 TGOLN2O43493 480 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 KRT75O95678 551 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA5P01569 189 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 OR10K2Q6IF99 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY9O60503 1353 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GW54 56 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 M0R036 132 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 E2F6O75461 281 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 REG1AP05451 166 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CCR7P32248 378 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GABRA2P47869 451 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 XCL1P47992 114 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GID4Q8IVV7 300 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 OR52B2Q96RD2 323 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms