RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR2H1Q9GZK4 316 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FXYD3Q14802 87 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR8B8Q15620 311 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 AGMATQ9BSE5 352 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PRO3102Q9H379 93 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 TDGF1P13385 188 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FGFRL1Q8N441 504 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 RNF2Q99496 336 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 RNF114Q9Y508 228 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SYNGR1O43759 233 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZG16O60844 167 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-5P01602 117 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf204Q6ZNR8 217 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OCC1Q8TAD7 63 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM147Q9BVK8 224 aa13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 HYPMO75409 117 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 CTXN2P0C2S0 81 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GNB4Q9HAV0 340 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 DPRXA6NFQ7 191 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 CRYGSP22914 178 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR1L1Q8NH94 360 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 LRFN3Q9BTN0 628 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZFHX4Q86UP3 3567 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFB8O95169 186 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RELBQ01201 579 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2V1Q13404 147 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 FBLN7Q53RD9 439 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 DHRS13Q6UX07 377 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 VENTXO95231 258 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TYMSP04818 313 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 CA6P23280 308 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 CTSSP25774 331 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SELENOTP62341 195 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 PRDX4Q13162 271 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D2AQ9NP31 389 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 NGFP01138 241 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 LOXL4Q96JB6 756 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 LAMA5O15230 3695 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ACTL6BO94805 426 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-39P01597 117 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1D-39P04432 117 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SRIP30626 198 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf35Q96D05 121 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 HINT2Q9BX68 163 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 CPT1CQ8TCG5 803 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 HSBP1O75506 76 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 NXPH2O95156 264 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV3-1P01715 115 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 COL8A2P25067 703 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 BPIFB3P59826 476 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf172C9J069 976 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 DEGS1O15121 323 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SYNGR4O95473 234 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 STUMQ69YW2 141 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 OR4A47Q6IF82 309 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 KCNE4Q8WWG9 221 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM265A0A087WTH1 108 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SSPNQ14714 243 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 OR1C1Q15619 314 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 STRADBQ9C0K7 418 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TP73-AS1Q9UF72 201 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 PCNX2A6NKB5 2137 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 PDE6DO43924 150 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99 ms