RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX45Q8NA69 505 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 UFD1Q92890 307 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPG2P98160 4391 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 C2orf70A6NJV1 201 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00473A8K010 186 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11H12B2RN74 326 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP5D1E7EU14 171 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DIRAS3O95661 229 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FOLR2P14207 255 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TPBGQ13641 420 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 IRF3Q14653 427 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 GUCA2BQ16661 112 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 NECAP1Q8NC96 275 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB3CQ96E17 227 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SPIN2AQ99865 258 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.07□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MFNGO00587 321 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL6IP5O75915 188 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2J3O76001 311 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 HSMCR30P0CW71 290 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 GNB3P16520 340 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS2P43631 304 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CDK10Q15131 360 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf32Q32M92 178 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 GINS4Q9BRT9 223 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB22AQ9UL26 194 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.06□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A075B6Q4 140 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0J9YWU9 116 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX22C9J3V5 150 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 EBAG9O00559 213 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTL6BO94805 426 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2C1O95371 312 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP5Q01469 135 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAM1Q15629 374 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 HES5Q5TA89 166 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MMD2Q8IY49 270 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 V9GY05 133 aa7.05□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM213A2RRL7 107 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 HMX3A6NHT5 357 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 J3QRK9 145 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS9O00182 355 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB27BO00194 218 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR3BO75015 233 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMD7P51665 324 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10A3P58181 314 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM209BQ5JX69 171 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZS49 121 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC140Q96MF4 163 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.04□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 SCN3BQ9NY72 215 aa7.04□□□□□ -1.28
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