RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SP9P0CG40 484 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 AZU1P20160 251 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 COX5AP20674 150 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OMGP23515 440 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 RAB9AP51151 201 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PAX9P55771 341 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 CLDN2P57739 230 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 HERV-K104P61576 105 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 MSMPQ1L6U9 139 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 LCN15Q6UWW0 184 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZS92 163 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZSR6 202 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ZNF525Q8N782 197 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 COX14Q96I36 57 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR2A5Q96R48 311 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 GPHA2Q96T91 129 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 SPXQ9BT56 116 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 HES4Q9HCC6 221 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 CACNA1HO95180 2353 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 MPDZO75970 2070 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 H0Y980 276 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 SSSCA1O60232 199 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PAGE4O60829 102 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 CXCL12P48061 93 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 EMDP50402 254 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 MFAP4P55083 255 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 RIPPLY3P57055 190 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TIRAPP58753 221 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PLP1P60201 277 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 CX3CL1P78423 397 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ZNF90Q03938 601 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 IGFBP7Q16270 282 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 RPEL1Q2QD12 228 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR4F5Q8NH21 305 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 BMFQ96LC9 184 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 DGAT2Q96PD7 388 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR6C1Q96RD1 312 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 GNB4Q9HAV0 340 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 RABAC1Q9UI14 185 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 USP34Q70CQ2 3546 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C7orf71A4D174 169 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR2T8A6NH00 312 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C10orf142B7Z368 130 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 F8W1H4 67 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CHST1O43916 411 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A7O60669 478 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CT45A6P0DMU7 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CT45A5P0DMU8 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CT45A7P0DMV0 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 AREGP15514 252 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IGLL1P15814 213 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GABRG2P18507 467 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 F2RP25116 425 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GPR1P46091 355 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ZNF83P51522 516 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 UBE2G1P62253 170 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 MPV17L2Q567V2 206 aa6.02□□□□□ -1.45
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