RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RGS5O15539 181 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 CNIH1O95406 144 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 CD33P20138 364 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MYCNOSP40205 109 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 HERV-K104P61576 105 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 GNB1P62873 340 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 PRSS8Q16651 343 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 TMEM65Q6PI78 240 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OR6F1Q8NGZ6 308 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OR52I2Q8NH67 350 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OR4S2Q8NH73 311 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RAX2Q96IS3 184 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 KLK11Q9UBX7 282 aa16.32■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 ACTBL2Q562R1 376 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 UBE2E2Q96LR5 201 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 DUX3Q96PT4 197 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 TNCP24821 2201 aa16.31■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS2P43631 304 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 DEFB136Q30KP8 78 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 C4orf3Q8WVX3 66 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 GNB4Q9HAV0 340 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 CCL24O00175 119 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RAMP3O60896 148 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 IGLL1P15814 213 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN5P62079 268 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 BORCS5Q969J3 196 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 VSIG4Q9Y279 399 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 I3L521 148 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.23e-25■■■■■ 36.7
ACTB-211ENST00000480301 CATR1Q13166 79 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 TNXAQ16473 311 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 DIRAS2Q96HU8 199 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 TMEM68Q96MH6 324 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MSGN1A6NI15 193 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 M0QYG6 137 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 DGCR2P98153 550 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RUNX1Q01196 453 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OR5T1Q8NG75 326 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 OR51H1Q8NH63 302 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 MS4A10Q96PG2 267 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ACTB-211ENST00000480301 GPR31O00270 319 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR2A4O95047 310 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 HRASP01112 189 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CD3DP04234 171 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 FHL3Q13643 280 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 MMD2Q8IY49 270 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 POC5Q8NA72 575 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR11H1Q8NG94 326 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 VSTM2AQ8TAG5 236 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RHOVQ96L33 236 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR5B12Q96R08 314 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR2A7Q96R45 310 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CCDC160A6NGH7 325 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 GABARAPH6UMI1 98 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 WIPF1O43516 503 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD11O94819 623 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 HPRT1P00492 218 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RLN1P04808 185 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SSX9Q7RTT3 188 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 H3BUA1 57 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CTDSPLO15194 276 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CD74P04233 296 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CD40LGP29965 261 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 UCP3P55916 312 aa16.24■□□□□ 0.19
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