RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GNB4Q9HAV0 340 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MSGN1A6NI15 193 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 I3L521 148 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SULT1C2O00338 296 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GNRHRP30968 328 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HRH1P35367 487 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RAB25P57735 213 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R46P59540 309 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HERV-K104P61576 105 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RUNX1Q01196 453 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TNXAQ16473 311 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PRSS8Q16651 343 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TMEM17Q86X19 198 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR4S2Q8NH73 311 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TMEM68Q96MH6 324 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.11□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CTDSP2O14595 271 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RGS5O15539 181 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RAMP3O60896 148 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR2A4O95047 310 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RCVRNP35243 200 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 KIR2DS2P43631 304 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TPPP2P59282 170 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN5P62079 268 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CATR1Q13166 79 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FHL3Q13643 280 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MMD2Q8IY49 270 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 BORCS5Q969J3 196 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MOB3AQ96BX8 217 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RHOVQ96L33 236 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR2A7Q96R45 310 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ABHD1Q96SE0 405 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PHB2Q99623 299 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 KLK11Q9UBX7 282 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PLXNB1O43157 2135 aa7.1□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 H3BUA1 57 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ACTL6BO94805 426 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TPPPO94811 219 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 KBTBD11O94819 623 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HPRT1P00492 218 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HRASP01112 189 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-11P01762 117 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TRGV3P03979 118 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 APELAP0DMC3 54 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZNF616Q08AN1 781 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SSX9Q7RTT3 188 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 REC114Q7Z4M0 266 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 LAX1Q8IWV1 398 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 POC5Q8NA72 575 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR51H1Q8NH63 302 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR52I2Q8NH67 350 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DPF1Q92782 380 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.09□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 H3BMQ9 156 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 GPR31O00270 319 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 MPPED1O15442 326 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 BRI3O95415 125 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 OR8U8P0C7N1 319 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 OR9G9P0C7N8 305 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R31P59538 309 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP10-11P60412 298 aa7.08□□□□□ -1.28
SYN3-211ENST00000472027 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.08□□□□□ -1.28
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