RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 TNFSF12O43508 249 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 WIPF1O43516 503 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-DMAP28067 261 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 HRH1P35367 487 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM17Q86X19 198 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF491Q8N8L2 437 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CD40LGP29965 261 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 RCVRNP35243 200 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 KIR2DS2P43631 304 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 PRSS8Q16651 343 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 BORCS5Q969J3 196 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 MOB3AQ96BX8 217 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 GNB4Q9HAV0 340 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 RGS5O15539 181 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CATR1Q13166 79 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SCOCQ9UIL1 159 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 TPPPO94811 219 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 GNRHRP30968 328 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 RAB25P57735 213 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 RUNX1Q01196 453 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 TNXAQ16473 311 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM68Q96MH6 324 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 I3L521 148 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 CTDSP2O14595 271 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ACTL6BO94805 426 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 HRASP01112 189 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 TSPAN5P62079 268 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 LAX1Q8IWV1 398 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 MMD2Q8IY49 270 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 OR5T1Q8NG75 326 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 OR11H1Q8NG94 326 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 VSTM2AQ8TAG5 236 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 ISOC1Q96CN7 298 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 MS4A10Q96PG2 267 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 OR5B12Q96R08 314 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 PHB2Q99623 299 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.46■□□□□ 0.07
CTPS1-206ENST00000470271 H3BMQ9 156 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 RAMP3O60896 148 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 OR2A4O95047 310 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 TPPP2P59282 170 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 FHL3Q13643 280 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 POC5Q8NA72 575 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 OR51H1Q8NH63 302 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 OR52I2Q8NH67 350 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 RHOVQ96L33 236 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 OR2A7Q96R45 310 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 ABHD1Q96SE0 405 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 KLK11Q9UBX7 282 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 MSGN1A6NI15 193 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 H3BUA1 57 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 TRGV3P03979 118 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 OR1N2Q8NGR9 330 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 KBTBD11O94819 623 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 APELAP0DMC3 54 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF616Q08AN1 781 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 CD300LFQ8TDQ1 290 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-206ENST00000470271 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms