RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A4	P12235	298 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	LYL1	P12980	280 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMB6	P28072	239 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CD300C	Q08708	224 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	AANAT	Q16613	207 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZRM9	215 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	RHOV	Q96L33	236 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SMR3A	Q99954	134 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	HMSD	A8MTL9	139 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CCS	O14618	274 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	LY86	O95711	162 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYZL1	O95825	349 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2K	P61086	200 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMM23	O14925	209 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	MPC2	O95563	127 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYGB	P07316	175 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	BRS3	P32247	399 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SAA4	P35542	130 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	G6PC	P35575	357 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	REG1B	P48304	166 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	AKR1C2	P52895	323 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK-16	P61578	105 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SSX2	Q16385	188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529		Q5BKY6	102 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	NOXA1	Q86UR1	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	NPB	Q8NG41	125 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	CHIA	Q9BZP6	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS13C	Q709C8	3753 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529		H7C2Y5	167 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	UPK2	O00526	184 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SHOX	O15266	292 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	VENTX	O95231	258 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	SPDEF	O95238	335 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	RLN2	P04090	185 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	RELB	Q01201	579 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529		Q8N6K4	173 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	NANP	Q8TBE9	248 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TRAF4-208	ENST00000469529	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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