RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PRB1	P04280	392 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SCT	P09683	121 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	DANCR	P0C864	163 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NPY4R	P50391	375 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HERV-K104	P61576	105 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	B2M	P61769	119 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	AES	Q08117	197 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PEA15	Q15121	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CCL17	Q92583	94 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CORO2A	Q92828	525 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GALM	Q96C23	342 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GPR137B	O60478	399 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MED6	O75586	246 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PPY	P01298	95 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	COL8A2	P25067	703 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IL2RG	P31785	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CD80	P33681	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	P2RY1	P47900	373 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GLIPR1	P48060	266 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MEOX2	P50222	304 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HTD2	P86397	168 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RHEB	Q15382	184 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108		Q5PR19	223 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	COQ2	Q96H96	371 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	LIME1	Q9H400	295 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ODAM	A1E959	279 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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