RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 SSX9Q7RTT3 188 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 MMD2Q8IY49 270 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf30Q96GV9 206 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SPIN2AQ99865 258 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SHISA3A0PJX4 238 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF320A2RRD8 509 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP5D1E7EU14 171 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TPPPO94811 219 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3-23P01764 117 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 FCER2P06734 321 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CTXN2P0C2S0 81 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CD36P16671 472 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMB9P28065 219 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 HSPA13P48723 471 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ARPC4P59998 168 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CD81P60033 236 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 MXD1Q05195 221 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CDK10Q15131 360 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8N402 240 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 OR51E2Q9H255 320 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 S4R3C0 116 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM235A6NFC5 223 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM223BA6NKX1 122 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TNFSF12O43508 249 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 AIREO43918 545 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC22A5O76082 557 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2A4O95047 310 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2C1O95371 312 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DIRAS3O95661 229 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFA4P12838 97 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 HACD4Q5VWC8 232 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 NECAP1Q8NC96 275 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DDB2Q92466 427 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 GPHA2Q96T91 129 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 NEURL2Q9BR09 285 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 RETNQ9HD89 108 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SSR3Q9UNL2 185 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TENM2Q9NT68 2774 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 NOTOA8MTQ0 251 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 BMPR1BO00238 502 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DQB1P01920 261 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 REG1AP05451 166 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 PTHLHP12272 177 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DTYMKP23919 212 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ARL3P36405 182 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF45Q02386 682 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 C15orf32Q32M92 178 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 IDNKQ5T6J7 187 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 CNIH2Q6PI25 160 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZS49 121 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 MFSD4AQ8N468 514 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB125Q8N687 156 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4S2Q8NH73 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2A7Q96R45 310 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-204ENST00000459646 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms