RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa20.5■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 RNF167Q9H6Y7 350 aa20.5■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 DIABLOQ9NR28 239 aa20.5■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 U3KQK5 164 aa20.5■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 TRAV18A0A075B6X5 111 aa20.49■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 MPPED1O15442 326 aa20.49■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 IGLV2-14P01704 120 aa20.49■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 OR9G9P0C7N8 305 aa20.49■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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ODC1-204ENST00000446285 SPNP16150 400 aa20.49■□□□□ 0.87
ODC1-204ENST00000446285 ARPC4P59998 168 aa20.49■□□□□ 0.87
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ODC1-204ENST00000446285 SPATA2Q9UM82 520 aa20.49■□□□□ 0.87
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ODC1-204ENST00000446285 IGKV1-13P0DP09 117 aa20.48■□□□□ 0.87
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ODC1-204ENST00000446285 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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ODC1-204ENST00000446285 SECTM1Q8WVN6 248 aa20.41■□□□□ 0.86
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ODC1-204ENST00000446285 C10orf55Q5SWW7 151 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 OR4A5Q8NH83 315 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 GIMAP1Q8WWP7 306 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 BORCS5Q969J3 196 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 YIPF6Q96EC8 236 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 CCL28Q9NRJ3 127 aa20.39■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.38■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 NPIPB5A8MRT5 1133 aa20.38■□□□□ 0.85
ODC1-204ENST00000446285 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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