RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF525Q8N782 197 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N7P7 452 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 LEAP2Q969E1 77 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM8Q96KF7 97 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.53□□□□□ -1.2
CCNDBP1-202ENST00000444658 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MARCH11A6NNE9 402 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 OOSP1A8MZH6 123 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 LY6LH3BQJ8 138 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 S1PR2O95136 353 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRASP01116 189 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5J2P56134 94 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 VAMP2P63027 116 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF266Q14584 549 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDPNQ86YL7 162 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 LHX4Q969G2 390 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf159Q96HA4 380 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBXL17Q9UF56 701 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.52□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PPE3 182 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX46H3BTG2 121 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 I3L521 148 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 WRBO00258 174 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCNAB3O43448 404 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYNGR2O43760 224 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHST1O43916 411 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-7P01780 117 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 APOA2P02652 100 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A16P16260 332 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 EPHA1P21709 976 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZP3P21754 424 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SULT1A2P50226 295 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 BLOC1S1P78537 153 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4A5Q8NH83 315 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MBD6Q96DN6 1003 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXorf58Q96LI9 332 aa7.51□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CEACAM3P40198 252 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAX9P55771 341 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00205P59089 165 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2KP61086 200 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAX8Q06710 450 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMUG1Q53HV7 270 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMED6Q8WW62 240 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 MARC2Q969Z3 335 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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