RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PRX2 142 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 FABP12A6NFH5 140 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR31O00270 319 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF12O43508 249 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 CD3DP04234 171 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 DGCR2P98153 550 aa13.19□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.19□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM68Q96MH6 324 aa13.19□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.17□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 RHOVQ96L33 236 aa13.17□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2A7Q96R45 310 aa13.17□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR51H1Q8NH63 302 aa13.16□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR4A5Q8NH83 315 aa13.15□□□□□ -0.3
RABGEF1-204ENST00000442563 GRPEL2Q8TAA5 225 aa13.15□□□□□ -0.3
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RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT19A8MXV4 375 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BUA1 57 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 KBTBD11O94819 623 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF735P0CB33 412 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 NQO2P16083 231 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 MAS1LP35410 378 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-204ENST00000442563 TNXAQ16473 311 aa13.14□□□□□ -0.31
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