RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 FHITP49789 147 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 LIPFP07098 398 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 STPG3Q8N7X2 389 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 OR51M1Q9H341 326 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 TP53RKQ96S44 253 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 SPTA1P02549 2419 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NUDT3O95989 172 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM187Q14656 261 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 TMEM186Q96B77 213 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 IFNL4K9M1U5 179 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.61□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SPTBP11277 2137 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRF-209ENST00000438120 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 FBXL15Q9H469 300 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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