RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 OR52B4Q8NGK2 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR1S1Q8NH92 325 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 COQ8AQ8NI60 647 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 NABP1Q96AH0 204 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf50Q96LR7 162 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 AQP10Q96PS8 301 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SELENOIQ9C0D9 397 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF702PQ9H963 129 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IFT46Q9NQC8 304 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 GPR84Q9NQS5 396 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KPTNQ9Y664 436 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR2AT4A6NND4 320 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 GLAP06280 429 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 COX5BP10606 129 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SAA4P35542 130 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CSNK1A1P48729 337 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R1AQ13522 171 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR8B8Q15620 311 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KISS1Q15726 138 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PHYHD1Q5SRE7 291 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SAXO1Q8IYX7 474 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CHST4Q8NCG5 386 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR8S1Q8NH09 359 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MARC2Q969Z3 335 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT14Q96FL9 552 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR2V2Q96R30 315 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RNF126Q9BV68 326 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RHOFQ9HBH0 211 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0A6YYD4 124 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C6A6NF89 314 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM20O43506 726 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SIX6O95475 246 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FSTL3O95633 263 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 HRH1P35367 487 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MYCNOSP40205 109 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1CBP62140 327 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SGCAQ16586 387 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MICBQ29980 383 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ODF4Q2M2E3 257 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM209BQ5JX69 171 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ELP2Q6IA86 826 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR10K2Q6IF99 312 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM29Q86T20 159 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 BAP18Q8IXM2 172 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 Q8N2B8 174 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 COMMD1Q8N668 190 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SGK3Q96BR1 496 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PGAM5Q96HS1 289 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 EMC6Q9BV81 110 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PECRQ9BY49 303 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ARV1Q9H2C2 271 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf49A4QMS7 147 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RER1O15258 196 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SOCS1O15524 211 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFA2O43678 99 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CHST1O43916 411 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RLN2P04090 185 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 HCKP08631 526 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms