RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK11-1P61568 191 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 VSNL1P62760 191 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN31Q12999 210 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 MMDQ15546 238 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 GUCA2BQ16661 112 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 Q8IYB0 196 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 Q8N402 240 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 CD1BP29016 333 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 CD40LGP29965 261 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 HCCSP53701 268 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 SYNJ2BPP57105 145 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 CDC42P60953 191 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 RAB40BQ12829 278 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 EBI3Q14213 229 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 PLGLAQ15195 96 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 UBE2V2Q15819 145 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0G2JND7 137 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-210ENST00000415055 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 M0R2N4 97 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 DEGS1O15121 323 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 E2F6O75461 281 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINA3P01011 423 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 NPPAP01160 153 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 TRGV3P03979 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF735P0CB33 412 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 HSD17B1P14061 328 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 FASP25445 335 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 HTR1FP30939 366 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 SSTR5P35346 364 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-210ENST00000415055 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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