RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OSR2Q8N2R0 312 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF714Q96N38 554 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.81□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C4orf51C9J302 202 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 UPK3AO75631 287 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 BGLAPP02818 100 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ISG15P05161 165 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ESDP10768 282 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MMP9P14780 707 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OPRK1P41145 380 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GLIPR1P48060 266 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PDLIM4P50479 330 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2V1Q13404 147 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MOB3BQ86TA1 216 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RABAC1Q9UI14 185 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 E9PQ18 207 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 H0Y980 276 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMPRSS2O15393 492 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZG16O60844 167 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP5LO75964 103 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NTN1O95631 604 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 AGAP20933 346 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR183P32249 361 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CA7P43166 264 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 KIR2DS2P43631 304 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB9AP51151 201 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL8P80075 99 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PIP4P1Q86T03 277 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF519Q8TB69 540 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TECTAO75443 2155 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 A8MXK9 166 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM250H0YL14 139 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNL4K9M1U5 179 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MPDU1O75352 247 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GNLYP22749 145 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 COX7A1P24310 79 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP6V0CP27449 155 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDX2P32119 198 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CKS2P33552 79 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYBB2P43320 205 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZP4Q12836 540 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PSG5Q15238 335 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PRSS8Q16651 343 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM45BQ96B21 275 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 DERL3Q96Q80 235 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM189A5PLL7 270 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PPIAL4DF5H284 164 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PLPP2O43688 288 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LANCL1O43813 399 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 VENTXO95231 258 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR4A8P0C604 315 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SPINK8P0C7L1 97 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HMGA2P52926 109 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PAX2Q02962 417 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZT83 130 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SHISA5Q8N114 240 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PELI1Q96FA3 418 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.79□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms