RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP6V1G2O95670 118 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 PET100P0DJ07 73 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPX2P18283 190 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRPRP30550 384 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CA5AP35218 305 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 HLA-DRB3P79483 266 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 NUMA1Q14980 2115 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM155Q4W5P6 130 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPHB5Q86YW7 130 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CD302Q8IX05 232 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR51T1Q8NGJ9 327 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC37A2Q8TED4 501 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ASB13Q8WXK3 278 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q96M85 177 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAD50Q92878 1312 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CHD5Q8TDI0 1954 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRAPPC13A5PLN9 417 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRPC5OSA6NMA1 111 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP8B1O43520 1251 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 IL6P05231 212 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPSAP08865 295 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CXCL2P19875 107 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CXCL3P19876 107 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CD40LGP29965 261 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLCO1A2P46721 670 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ELOBQ15370 118 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q1T7F1 81 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ACSM3Q53FZ2 586 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 BOD1L2Q8IYS8 172 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q8N402 240 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 IMMP2LQ96T52 175 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 NMNAT3Q96T66 252 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 DHRS9Q9BPW9 319 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 TIPINQ9BVW5 301 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CHST6Q9GZX3 395 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 MS4A6AQ9H2W1 248 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 WDR54Q9H977 334 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 EURLQ9NYK6 297 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 CFAP45Q9UL16 551 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANGPT4Q9Y264 503 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-57P-201ENST00000411348 FREM1Q5H8C1 2179 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 REREQ9P2R6 1566 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A0D9SEW6 157 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR51F1A6NGY5 319 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMLR1H3BR10 107 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 CRPP02741 224 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 MSMBP08118 114 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 RD3LP0DJH9 198 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 CXCR4P61073 352 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAB14P61106 215 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLCXD2Q0VAA5 305 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMED1Q13445 227 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC36A2Q495M3 483 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 C9orf64Q5T6V5 341 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM78BQ5VT40 261 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 SBSNQ6UWP8 590 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM86AQ8N2M4 240 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR7G1Q8NGA0 311 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAB2BQ8WUD1 216 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMIM19Q96E16 107 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCL13Q99616 98 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TTTY13Q9BZ97 58 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 NDEL1Q9GZM8 345 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPACA1Q9HBV2 294 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 AK3Q9UIJ7 227 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPRBP23467 1997 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-57P-201ENST00000411348 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms