RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CORO2AQ92828 525 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5SQ99766 215 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PARP11Q9NR21 331 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM218A2RU14 115 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM11P17152 192 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVK-16P61578 105 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UQCC3Q6UW78 93 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4A16Q8NH70 328 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DTD1Q8TEA8 209 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF714Q96N38 554 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CTSZQ9UBR2 303 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP50Q9UKX7 468 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LRBAP50851 2863 aa3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT19A8MXV4 375 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 F8W036 122 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGB1BP1O14713 200 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LY6HO94772 140 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NQO2P16083 231 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB5CP51148 216 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R30P59541 319 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HBG1P69891 147 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HBG2P69892 147 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 BTN1A1Q13410 526 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RSG1Q9BU20 258 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ITPR1Q14643 2758 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UQCRFS1P47985 274 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 THBS3P49746 956 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF525Q8N782 197 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF383Q8NA42 475 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4S2Q8NH73 311 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DDB2Q92466 427 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4C12Q96R67 309 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GAB2Q9UQC2 676 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA1AO00555 2505 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UMAD1C9J7I0 102 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM77I1YAP6 450 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFA2O43678 99 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DAOP14920 347 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DS2P43631 304 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 REG1BP48304 166 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TFF3Q07654 80 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 AVPI1Q5T686 147 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM140Q9NV12 185 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.26□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C9JQL5 133 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 H7C2Y5 167 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CT45A6P0DMU7 189 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CT45A5P0DMU8 189 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CT45A7P0DMV0 189 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCYAP1P18509 176 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 M6PRP20645 277 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GNLYP22749 145 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SNCAP37840 140 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PPT1P50897 306 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GUCA2BQ16661 112 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GUK1Q16774 197 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms