RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403534.7

BCL3-202, Transcript of B cell CLL/lymphoma 3, humanhuman

TSL 2

Gene BCL3, Length 1,714 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3-202ENST00000403534 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 Q6ZS49 121 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.65□□□□□ -0.06
BCL3-202ENST00000403534 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 H3BQ15 152 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 H7C1Q1 480 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HSPA12AO43301 675 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HBE1P02100 147 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SSTR5P35346 364 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HLA-DRB3P79483 266 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ELOBQ15370 118 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 RAB24Q969Q5 203 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 MBD6Q96DN6 1003 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SSX3Q99909 188 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 AKAP9Q99996 3911 aa14.64□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 A0A087X0M5 115 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 A0A1B0GX30 115 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 C12orf77C9JDV5 145 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ST8SIA3O43173 380 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 IL2RGP31785 369 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 RAB39BQ96DA2 213 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 OR8B2Q96RD0 313 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 NDUFS8O00217 210 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BKO60814 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SCGB1D2O95969 90 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BJP06899 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BOP23527 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BBP33778 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BDP58876 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 LMO4P61968 165 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BCP62807 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 GNMTQ14749 295 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ITPR3Q14573 2671 aa14.63□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ZANQ9Y493 2812 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 A0A1B0GV90 55 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 TRDCB7Z8K6 153 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 RD3LP0DJH9 198 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SRPXP78539 464 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 LGI3Q8N145 548 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PRR18Q8N4B5 295 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 OR1L1Q8NH94 360 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 NINJ1Q92982 152 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 NAA60Q9H7X0 242 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 CLN8Q9UBY8 286 aa14.62□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 25.3
BCL3-202ENST00000403534 C22orf46C9J442 243 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 C15orf65H3BRN8 121 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 CGB3P0DN86 165 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 CGB7P0DN87 165 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 CR1LQ2VPA4 569 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 Q8WTZ3 238 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 WFDC1Q9HC57 220 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 A0A096LNT2 108 aa14.61□□□□□ -0.07
BCL3-202ENST00000403534 SMCO3A2RU48 225 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms