RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ERVK-16P61578 105 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 MPDU1O75352 247 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 VENTXO95231 258 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM249Q2WGJ8 235 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 OR51G1Q8NGK1 321 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 F2RL2O00254 374 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 GYPAP02724 150 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 RAB1CQ92928 201 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PITPNC1Q9UKF7 332 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 IFNA10P01566 189 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DS2P43631 304 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PDZD11Q5EBL8 140 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 SSX9Q7RTT3 188 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 GCSAMQ8N6F7 178 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 OR4X1Q8NH49 305 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PLPPR2Q96GM1 343 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf94C9JXX5 98 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 LRP11Q86VZ4 500 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 NECAP1Q8NC96 275 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 LOXL3P58215 753 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MSMPQ1L6U9 139 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 Q8TCH9 128 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 S100PBPQ96BU1 408 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PFDN5Q99471 154 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 GAB2Q9UQC2 676 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 HRASP01112 189 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 RPL39P5Q59GN2 51 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB124Q8NES8 71 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 S1PR3Q99500 378 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF383Q8NA42 475 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 FAM234AQ9H0X4 552 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 IFI27L2Q9H2X8 130 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PDE6DO43924 150 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV3-13P01766 116 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 DEFA4P12838 97 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 OPRK1P41145 380 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF83P51522 516 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF600Q6ZNG1 722 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 OR2V2Q96R30 315 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PPV4 95 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 PPP5D1E7EU14 171 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 FABP4P15090 132 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 RELBQ01201 579 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MEGF10Q96KG7 1140 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF134P52741 427 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 EDDM3BP56851 147 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 SEM1Q6ZVN7 128 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 MOGAT3Q86VF5 341 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 CALYQ9NYX4 217 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 ITGB1BP1O14713 200 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 SRP14P37108 136 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 RAB7AP51149 207 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 TMPRSS3P57727 454 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 TREML4Q6UXN2 200 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 ZNRF1Q8ND25 227 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 RAB9BQ9NP90 201 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD13-201ENST00000392539 M0R1B8 84 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 RTP5Q14D33 572 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 KCNIP2Q9NS61 270 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM140Q9NV12 185 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 RRHO14718 337 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 NPPCP23582 126 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 GCSAMLQ5JQS6 135 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS46E5RG02 174 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 GFRA3O60609 400 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 LHBP01229 141 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 DEFA6Q01524 100 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM183AQ8IXX5 376 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 OR4S2Q8NH73 311 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 DDB2Q92466 427 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 ELOVL1Q9BW60 279 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 GFOD1Q9NXC2 390 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 F6UZH7 168 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 GLRXP35754 106 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 SPRNQ5BIV9 151 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf152Q5JTZ5 239 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD13-201ENST00000392539 CDPF1Q6NVV7 123 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms