RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCL2P13500 99 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CARD18P57730 90 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNAP25P60880 206 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA24Q86W54 205 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8B3Q8NGG8 313 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARVAQ9NVD7 372 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM212A6NML5 194 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9JCJ5 164 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFS8O00217 210 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 FADS2O95864 444 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MT-CO2P00403 227 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 HLA-DQB2P05538 268 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35E2BP0CK96 405 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSNP26038 577 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMAGPQ0VAQ4 97 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNA13Q14344 377 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACSM3Q53FZ2 586 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM27BQ5VT28 67 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACOT12Q8WYK0 555 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 METTL9Q9H1A3 318 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD300AQ9UGN4 299 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 POFUT2Q9Y2G5 429 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABCC12Q96J65 1359 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TONSLQ96HA7 1378 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087WX48 190 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 DAPL1A0PJW8 107 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP5G1P05496 136 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFPTP0C1Z6 253 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00614P0C842 121 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 F8A1P23610 371 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLCO1A2P46721 670 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPCAP84074 193 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFA5Q16718 116 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPHB5Q86YW7 130 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SBSPONQ8IVN8 264 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4C6Q8NH72 309 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB2BQ8WUD1 216 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSANTD3Q96H12 275 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED10Q9BTT4 135 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASCL3Q9NQ33 180 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5AC2Q9NZP5 309 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 LHFPL6Q9Y693 200 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 LAMA4Q16363 1823 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHD5Q8TDI0 1954 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP3K19Q56UN5 1328 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIPA1L1O43166 1804 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF24Q5T7B8 1368 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA6L10A6NI86 522 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 METTL15A6NJ78 407 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAPPC2LH3BP13 241 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSMBP08118 114 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAAOP46952 286 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 FABP5Q01469 135 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52E4Q8NGH9 312 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 STOML3Q8TAV4 291 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 AQP3Q92482 292 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYTH2Q99418 400 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MROQ9BYG7 248 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GP1BAP07359 652 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRPRP30550 384 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCN1P31025 176 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYCP1Q15431 976 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHFR2Q86XF0 187 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 BLIDQ8IZY5 108 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASB13Q8WXK3 278 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 YIPF3Q9GZM5 350 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIMM22Q9Y584 194 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM94Q12767 1356 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 PMP2P02689 132 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 CXCL2P19875 107 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF676Q8N7Q3 588 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPERTQ8NA61 448 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10D3Q8NH80 312 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5AK3PQ8NH89 298 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPCDCQ96CD2 204 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPRSQ13332 1948 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms