RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369699.8

SORCS3-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SORCS3, Length 5,530 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3-201ENST00000369699 PQLC2LA1A4F0 135 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 AWAT1Q58HT5 328 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 C9orf62Q8N4C0 152 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 PRSS1P07477 247 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 Q0VFX4 171 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SLC16A13Q7RTY0 426 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ZIC4Q8N9L1 334 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 OR10C1Q96KK4 312 aa16■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ZG16O60844 167 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SPANXN1Q5VSR9 72 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 GNLYP22749 145 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 MDS2Q8NDY4 140 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 WBP1Q96G27 269 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 DCAF16Q9NXF7 216 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 RPL7P18124 248 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 KLK2P20151 261 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 NPPCP23582 126 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 M0R2Z0 102 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TRGV3P03979 118 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 DDB2Q92466 427 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 OR5AU1Q8NGC0 362 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 DUX5Q96PT3 197 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TXNDC17Q9BRA2 123 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 A0A0G2JLM5 398 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 IGKV1D-33P01593 117 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 IGKV1-33P01594 117 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 REG1AP05451 166 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 GGNQ86UU5 652 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TUBD1Q9UJT1 453 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 CD300CQ08708 224 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 FOXF2Q12947 444 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 LYPD3O95274 346 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 CRISP2P16562 243 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SYT8Q8NBV8 401 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SPTBP11277 2137 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TRAV34A0A0B4J273 112 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 A0A1B0GTI1 187 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TMEM187Q14656 261 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 DLK1P80370 383 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SMIM8Q96KF7 97 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ZNF253O75346 499 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 Q6ZS92 163 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 GPHA2Q96T91 129 aa15.97■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 RUNX1Q01196 453 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 MOSP00540 346 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 CACNA1EQ15878 2313 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 SCN2AQ99250 2005 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TMEM218A2RU14 115 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 ISLRO14498 428 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.96■□□□□ 0.15
SORCS3-201ENST00000369699 TSPOP30536 169 aa15.96■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 MIC13Q5XKP0 118 aa15.96■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 A0A0G2JK05 382 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 TMEM189A5PLL7 270 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 RSG1Q9BU20 258 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 ANK1P16157 1881 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 ISOC2Q96AB3 205 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 PLAUP00749 431 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 HIST3H3Q16695 136 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 STPG2Q8N412 459 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 BCL2P10415 239 aa15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 FBXL15Q9H469 300 aa15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 FAM74A7A6NL05 159 aa15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 OR4B1Q8NGF8 309 aa15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 OR2D3Q8NGH3 330 aa15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SORCS3-201ENST00000369699 RNF224P0DH78 156 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms