RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 A6NDN8 102 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf52A6NGY3 159 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 WNT9BO14905 357 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TFPI2P48307 235 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5J2P56134 94 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 RND3P61587 244 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF738Q8NE65 137 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 MEGF10Q96KG7 1140 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TM2D1Q9BX74 207 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 DANCRP0C864 163 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNRF1Q8ND25 227 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SPSB4Q96A44 273 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CECR9P0C854 216 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 NUBP1P53384 320 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF146Q15072 292 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C1QL2Q7Z5L3 287 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 GATAD1Q8WUU5 269 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 H0YL77 283 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 RAB9AP51151 201 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF383Q8NA42 475 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CD8AP01732 235 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF708P17019 499 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 FAM106AQ4KMX7 169 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP30Q9Y2G7 519 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SCN2AQ99250 2005 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TRGC2P03986 189 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 PKIAP61925 76 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 RNF224P0DH78 156 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TP53RKQ96S44 253 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TBX15Q96SF7 602 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 OR51M1Q9H341 326 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 RELBQ01201 579 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 Q5BKY6 102 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 FADS6Q8N9I5 356 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CHODLQ9H9P2 273 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF10P50591 281 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ERVH48-1M5A8F1 160 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 FOXH1O75593 365 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF841Q6ZN19 808 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 PNKDQ8N490 385 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf65A6NEN9 183 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ARL14EPLP0DKL9 152 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CKS2P33552 79 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CEACAM1P13688 526 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 RPL24P83731 157 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPB3Q92617 1050 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 NABP2Q9BQ15 211 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 NHLRC3Q5JS37 347 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT14Q96FL9 552 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JK05 382 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF98A6NK75 572 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf77C9JDV5 145 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 FAM27E3Q08E93 113 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA1O95477 2261 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 PDLIM4P50479 330 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 RPS20P60866 119 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf68Q2NKX9 166 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 DDB2Q92466 427 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 M0R3E3 92 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CA7P43166 264 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 PSG9Q00887 426 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 HSPB9Q9BQS6 159 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM106BQ9NUM4 274 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP20933 346 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD3Q14802 87 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM177Q53S58 311 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SYT8Q8NBV8 401 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SH3BGRL3Q9H299 93 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 AUP1Q9Y679 476 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBB3P26998 211 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CRIPAKQ8N1N5 446 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPB6E9PJ23 425 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01560Q8TB33 94 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 ROS1P08922 2347 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 GCGP01275 180 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CDK2AP1O14519 115 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-203ENST00000366687 UCP1P25874 307 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms