RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 HPRT1P00492 218 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 HRASP01112 189 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 NMSQ5H8A3 153 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 SULT1A1P50225 295 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 SSX2Q16385 188 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 STPG2Q8N412 459 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 OR4C12Q96R67 309 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 SLC25A22Q9H936 323 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 A0A1W2PPV4 95 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IGKV1-16P04430 117 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OR9G9P0C7N8 305 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 Q6ZS49 121 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C15orf65H3BRN8 121 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IFT22Q9H7X7 185 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CTSZQ9UBR2 303 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 A0A1W2PPH5 198 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LINC00862A6NCI5 91 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IL3RAP26951 378 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PERPQ96FX8 193 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 J3QR06 171 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 YPEL1O60688 119 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 HTD2P86397 168 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ID3Q02535 119 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 HCP5Q6MZN7 132 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LHX4Q969G2 390 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 YPEL2Q96QA6 119 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SIAH2O43255 324 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 UBE2G2P60604 165 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RAB11AP62491 216 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 KLRD1Q13241 179 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TNXAQ16473 311 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CST9LP1Q5W188 147 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LRTM2Q8N967 370 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LHBP01229 141 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ARG1P05089 322 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 GATA4P43694 442 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SSX8Q7RTT4 187 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ATP5SQ99766 215 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 USP24Q9UPU5 2620 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C19orf84I3L1E1 186 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 THBS3P49746 956 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF525Q8N782 197 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 NRGNQ92686 78 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OR4A47Q6IF82 309 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C5orf30Q96GV9 206 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IGLV2-14P01704 120 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 WNT2P09544 360 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 COL8A1P27658 744 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PLA2G5P39877 138 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF383Q8NA42 475 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 DOK5Q9P104 306 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PRRX1P54821 245 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ATP5J2P56134 94 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TLE4Q04727 773 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.55□□□□□ -0.88
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