RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 RDH5Q92781 318 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 WNT9BO14905 357 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 BRS3P32247 399 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 MKXQ8IYA7 352 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 DTD1Q8TEA8 209 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 TMEM250H0YL14 139 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 IL22RA2Q969J5 263 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 MS4A10Q96PG2 267 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 TBX15Q96SF7 602 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 DIRC2Q96SL1 478 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 CACNA1DQ01668 2161 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 NXPH3O95157 252 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 PRSS8Q16651 343 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 ACACBO00763 2458 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX11-201ENST00000359238 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 J3QT63 122 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 IFNL4K9M1U5 179 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 LCN2P80188 198 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 VHLLQ6RSH7 139 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 RND1Q92730 232 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 RAB40CQ96S21 281 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 SCTP09683 121 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ERVK11-1P61568 191 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 KCNIP4Q6PIL6 250 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 PKIBQ9C010 78 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 NAPSAO96009 420 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 Q6P435 159 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 GAPTQ8N292 157 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ZNF525Q8N782 197 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 DUSP13Q9UII6 198 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 LRP5LA4QPB2 252 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 H3BP45 60 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 RPL15P61313 204 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 NEK7Q8TDX7 302 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 PARLQ9H300 379 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 C16orf97H3BN30 126 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 SIRPB1O00241 398 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 YPEL1O60688 119 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 SLC25A6P12236 298 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 RANP62826 216 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 PCSK4Q6UW60 755 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 TEX43Q6ZNM6 134 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 UBALD1Q8TB05 177 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 LHX4Q969G2 390 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 YPEL2Q96QA6 119 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 GPHA2Q96T91 129 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 JKAMPQ9P055 326 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 KITLGP21583 273 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 CA7P43166 264 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 Q6ZS49 121 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 BTF3L4Q96K17 158 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 H0Y980 276 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 CRYAAP02489 173 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 GYPAP02724 150 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 PSMB3P49720 205 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 SDSLQ96GA7 329 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 ELOVL5Q9NYP7 299 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.48■□□□□ 0.07
SNX11-201ENST00000359238 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms