RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 EHFQ9NZC4 300 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF12O43508 249 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP10-11P60412 298 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP3S1Q92572 193 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A10Q96PG2 267 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMP2P02689 132 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFX2P48378 723 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPPP2P59282 170 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R46P59540 309 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF616Q08AN1 781 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYRK1AQ13627 763 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNXAQ16473 311 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MZT2AQ6P582 158 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM17Q86X19 198 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 POC5Q8NA72 575 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1N2Q8NGR9 330 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HERV-K104P61576 105 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPCS2Q15005 226 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5T1Q8NG75 326 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOB3AQ96BX8 217 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM68Q96MH6 324 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BUA1 57 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAMP3O60896 148 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-11P01762 117 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRGV3P03979 118 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8U8P0C7N1 319 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRH1P35367 487 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS2P43631 304 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPF1Q92782 380 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM25AB3EWG3 89 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM25CB3EWG5 89 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM25GB3EWG6 89 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1C2O00338 296 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 APELAP0DMC3 54 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DMAP28067 261 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD40LGP29965 261 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMD2Q8IY49 270 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRAPQ8TCY5 172 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOVQ96L33 236 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHB2Q99623 299 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WW49 117 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSGN1A6NI15 193 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 KBTBD11O94819 623 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A4O95047 310 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRI3O95415 125 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNRHRP30968 328 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCVRNP35243 200 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATR1Q13166 79 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A7Q96R45 310 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01619G3V211 115 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7EIL1 84 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLURP1P55000 103 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFA5Q01523 94 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51H1Q8NH63 302 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSTM2AQ8TAG5 236 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTL6BO94805 426 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRASP01112 189 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMBIM6P55061 237 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSX9Q7RTT3 188 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms