RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R1W7 72 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF224P0DH78 156 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 MC5RP33032 325 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR2BP41595 481 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2KP61086 200 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 BAP18Q8IXM2 172 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 LHX4Q969G2 390 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM8Q96KF7 97 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C2Y5 167 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFS8O00217 210 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYZL1O95825 349 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 P0C879 139 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF137PP52743 207 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ARF6P62330 175 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF9Q07011 255 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 BAXQ07812 192 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 STX12Q86Y82 276 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 STOML3Q8TAV4 291 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOVQ96L33 236 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCC1Q96S66 551 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PSENENQ9NZ42 101 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 C22orf46C9J442 243 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA17P01571 189 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV2-5P01817 119 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-39P01824 125 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PRTN3P24158 256 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB13P51153 203 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5J2P56134 94 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 NHLH2Q02577 135 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.094e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 MIDNQ504T8 468 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SSX9Q7RTT3 188 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF525Q8N782 197 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52E5Q8NH55 327 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SHOXO15266 292 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNL1O43396 289 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXH1O75593 365 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 NXPH3O95157 252 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 DSCR9P59020 149 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SPCS3P61009 180 aa8.22□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 CLLU1Q5K131 121 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF429Q86V71 674 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM140Q9NV12 185 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL17Q9UF56 701 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 KPTNQ9Y664 436 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 KALRNO60229 2985 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 A1L4Q6 167 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 LEUTXA8MZ59 168 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YJW9 148 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV1-47P01700 117 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM3P40198 252 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT1A1P50225 295 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PAX9P55771 341 aa8.21□□□□□ -1.09
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