RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIX6O95475 246 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOSP00540 346 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGALS7P47929 136 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T10Q8NGZ9 312 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF5Q99942 180 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-5P01602 117 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP14Q86UN6 197 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHIAQ9BZP6 476 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD24P25063 80 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD83Q01151 205 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNF4GQ14541 408 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 PFDN1O60925 122 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNKO75909 580 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY6G6DO95868 133 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 VMA21Q3ZAQ7 101 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMSQ5H8A3 153 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL17RELQ6ZVW7 336 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 THNSL2Q86YJ6 484 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 C22orf15Q8WYQ4 148 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR146Q96CH1 333 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPTX1A8MV57 137 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYNLT3P51808 116 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 H2BFSP57053 126 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYCSP99999 105 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSTM2AQ8TAG5 236 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf50Q96LR7 162 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSX3Q99909 188 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMR3AQ99954 134 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM140Q9NV12 185 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSKIPQ9P0R6 139 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTOGQ6ZRI0 2925 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GU03 582 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM11P17152 192 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU2AF1Q16633 256 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC9AQ6UXN8 241 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC16Q969W1 377 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10C1Q96KK4 312 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM160Q9NX00 188 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX15Q9BXT5 2789 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0G2JRQ6 117 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMCO1Q147U7 214 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CACNG5Q9UF02 275 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNAPC5O75971 98 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2A4O95047 310 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIPP09681 153 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A6P12236 298 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 EBI3Q14213 229 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4A47Q6IF82 309 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4A16Q8NH70 328 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1S1Q8NH92 325 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 RITA1Q96K30 269 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1456Q9P272 454 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A17O43808 307 aa21.98■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 P0C879 139 aa21.98■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMES1Q9C002 83 aa21.98■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BET1LQ9NYM9 111 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV2-23P01705 113 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLGLAQ15195 96 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSG5Q15238 335 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX45Q8NA69 505 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4A5Q8NH83 315 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1RLQ9NZP8 487 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBR2O15453 112 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTFRP26992 372 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACANP16112 2415 aa21.96■■□□□ 1.11
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