RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CNBD2Q96M20 576 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 SPIN2AQ99865 258 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 BMPR1BO00238 502 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 FCGR3BO75015 233 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CDNFQ49AH0 187 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 C22orf42Q6IC83 251 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 KCTD9Q7L273 389 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 MMD2Q8IY49 270 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM30A4D0T7 59 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 AIREO43918 545 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 TUSC2O75896 110 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 VCX3BQ9H321 246 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-DQB1P01920 261 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 IFNA6P05013 189 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CTXN2P0C2S0 81 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 GALP22466 123 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 NECAP1Q8NC96 275 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 TNCP24821 2201 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 OR2J3O76001 311 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CD36P16671 472 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA13P48723 471 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CD81P60033 236 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 HACD4Q5VWC8 232 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 HMX3A6NHT5 357 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 SLC22A5O76082 557 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 IGLV2-14P01704 120 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 C15orf32Q32M92 178 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 OR51E2Q9H255 320 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 RYR2Q92736 4967 aa14.83□□□□□ -0.03
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM235A6NFC5 223 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 NOTOA8MTQ0 251 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 PPP5D1E7EU14 171 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 CNIH2Q6PI25 160 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 LAX1Q8IWV1 398 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 NEURL2Q9BR09 285 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 RETNQ9HD89 108 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF785A8K8V0 405 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TEX22C9J3V5 150 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TPPPO94811 219 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 GNG2P59768 71 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB114Q30KQ6 69 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 FAM209BQ5JX69 171 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 OR4S2Q8NH73 311 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 OR2A7Q96R45 310 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA2Q9UM82 520 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 DPPA5A6NC42 116 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 SSX5O60225 188 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 KBTBD11O94819 623 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 OR2C1O95371 312 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 CD7P09564 240 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL3-201ENST00000296026 EDN2P20800 178 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms