RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00114Q6XXX2 140 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 PGLYRP4Q96LB8 373 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0B4J293 547 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 RPRMQ9NS64 109 aa18.02■□□□□ 0.48
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD3Q14802 87 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM12Q96EX1 92 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM70Q9BUB7 260 aa18.02■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 RAB9AP51151 201 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SYT8Q8NBV8 401 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SFRP2Q96HF1 295 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1LC3AQ9H492 121 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 DMRT1Q9Y5R6 373 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 H3BVH4 76 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TM4SF20Q53R12 229 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf51A8MQB3 221 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 CRXO43186 299 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GCHFRP30047 84 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 NRN1LQ496H8 165 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 OR4A47Q6IF82 309 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZT83 130 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAL4GP0DN37 164 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 MUC15Q8N387 334 aa18.01■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE10A6NGK3 116 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SYNGR3O43761 229 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 UCP1P25874 307 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 FAM209BQ5JX69 171 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A34Q6PIV7 304 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PLSCR2Q9NRY7 297 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TIAF1O95411 115 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 WNT9BO14905 357 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB6E9PJ23 425 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PF4V1P10720 104 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GCSHP23434 173 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TCF24Q7RTU0 167 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 OR10S1Q8NGN2 331 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GUCD1Q96NT3 240 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TIMP4Q99727 224 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 EPOPA6NHQ4 379 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 FABP2P12104 132 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GGACTQ9BVM4 153 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 MSGN1A6NI15 193 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DRB1P01911 266 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 OR10AG1Q8NH19 301 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 RNF115Q9Y4L5 304 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 EFNB1P98172 346 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf83Q53S99 150 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK4Q6UW60 755 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ERASQ7Z444 233 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 RAMP1O60894 148 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 RAB37Q96AX2 223 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 A8MXK9 166 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TGIF1Q15583 401 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB3Q92617 1050 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 LEAP2Q969E1 77 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 MIEN1Q9BRT3 115 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC7AQ9BXN2 247 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PQLC2LA1A4F0 135 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 COX6CP09669 75 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ANOS1P23352 680 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 LCN2P80188 198 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ALPK2Q86TB3 2170 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ZIC3O60481 467 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GLRXP35754 106 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 CDK2AP1O14519 115 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM183AQ8IXX5 376 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 NPCDR1Q9BY65 106 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 AICDAQ9GZX7 198 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SIAH2O43255 324 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 GDF9O60383 454 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM74BQ9NUR3 256 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-201ENST00000284617 SCN4AP35499 1836 aa17.96■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf77C9JDV5 145 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 CX3CL1P78423 397 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1644Q3SXP7 199 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 CENPWQ5EE01 88 aa17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms