RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 TNFRSF9Q07011 255 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PDPNQ86YL7 162 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR4A16Q8NH70 328 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 RPEQ96AT9 228 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 HARBI1Q96MB7 349 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 NABP2Q9BQ15 211 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.75□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SHOXO15266 292 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 IGKV1-16P04430 117 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 UBE2KP61086 200 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 LMO4P61968 165 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 BAXQ07812 192 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 KLRD1Q13241 179 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 POU2AF1Q16633 256 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR4A47Q6IF82 309 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 STX12Q86Y82 276 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR8H3Q8N146 312 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 STOML3Q8TAV4 291 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 RHOVQ96L33 236 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 GSX2Q9BZM3 304 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 RBKSQ9H477 322 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PSENENQ9NZ42 101 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 NUP50Q9UKX7 468 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 KPTNQ9Y664 436 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 C15orf61A6NNL5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 VWC2LB2RUY7 222 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 TMEM50AO95807 157 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 IFNA17P01571 189 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PAX1P15863 534 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PRTN3P24158 256 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 MC5RP33032 325 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 DSCR9P59020 149 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 NDUFA5Q16718 116 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 TMEM177Q53S58 311 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 DTD1Q8TEA8 209 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CLCC1Q96S66 551 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 ODF3BA8MYP8 253 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 LEUTXA8MZ59 168 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 FAM157AC9JC47 383 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CST7O76096 145 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 HTR1DP28221 377 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CEACAM3P40198 252 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PAX9P55771 341 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 TAS2R30P59541 319 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 RAB14P61106 215 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 RELBQ01201 579 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 NHLH2Q02577 135 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 PAX2Q02962 417 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SPINK9Q5DT21 86 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 ZNF429Q86V71 674 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 BAP18Q8IXM2 172 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 LHX4Q969G2 390 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SMIM8Q96KF7 97 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 SIRPDQ9H106 197 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.73□□□□□ -1.33
COPS4-201ENST00000264389 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms