RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-201	ENST00000262291	MGST3	O14880	152 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	DYNLT3	P51808	116 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF134	P52741	427 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	TLE1	Q04724	770 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	HNF4G	Q14541	408 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	IL19	Q9UHD0	177 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.26	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	JTB	O76095	146 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	TNFSF4	P23510	183 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	NUP37	Q8NFH4	326 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CCL17	Q92583	94 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	MARCH11	A6NNE9	402 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CLDN1	O95832	211 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GAFA1	Q96PS6	74 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.25	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291		A6NNC1	897 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291		E7EQL1	145 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	TMPRSS2	O15393	492 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	PROP1	O75360	226 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	MMP23A	O75900	390 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CLDN14	O95500	239 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CFHR2	P36980	270 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	RUNX1	Q01196	453 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	HAGH	Q16775	308 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	C17orf100	A8MU93	164 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291		H3BQ15	152 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	PITX3	O75364	302 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	NPS	P0C0P6	89 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	IRF2	P14316	349 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GNG10	P50151	68 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	UBE2K	P61086	200 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	SHISA9	B4DS77	424 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GZMB	P10144	247 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	PLA2G5	P39877	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GPR12	P47775	334 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	MORN2	Q502X0	79 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	STUM	Q69YW2	141 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291		A0A1B0GU03	582 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291		M0R1X1	148 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	MAS1L	P35410	378 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GATA4	P43694	442 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	CCL20	P78556	96 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	UCN	P55089	124 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	LOXL3	P58215	753 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	DLK1	P80370	383 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	FCGR3B	O75015	233 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	PAX1	P15863	534 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	GZMH	P20718	246 aa		11.22	□□□□□ -0.61
VMP1-201	ENST00000262291	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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