RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 C21orf62Q9NYP8 219 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 TM4SF5O14894 197 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 SEC11BP0C7V7 166 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 FSTP19883 344 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 ARL17AQ8IVW1 177 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 CELA3AP09093 270 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 XAF1Q6GPH4 301 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 FAM166AQ6J272 317 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 PCM1Q15154 2024 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 ERASQ7Z444 233 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 PRO1933Q9H354 126 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 SEC16AO15027 2179 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 H3BRM9 83 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-201ENST00000220888 IFI6P09912 130 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 CD33P20138 364 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 GNLYP22749 145 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF9Q07011 255 aa8.97□□□□□ -0.97
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