RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000200181.7

ITGB4-201, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGB4, Length 5,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-201ENST00000200181 C9JCJ5 164 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 LAMA4Q16363 1823 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 NDUFA2O43678 99 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 NGFRP08138 427 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 VCX2Q9H322 139 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 NUP205Q92621 2012 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 CACNA1SQ13698 1873 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 HOXA5P20719 270 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 LIMS1P48059 325 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 TEX29Q8N6K0 151 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 TMEM187Q14656 261 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 H7C1H1 209 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 IGKV3-20P01619 116 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 FHITP49789 147 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 LY6EQ16553 131 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 AMELYQ99218 206 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGB4-201ENST00000200181 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SPINT1O43278 529 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 H2BFSP57053 126 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 LEAP2Q969E1 77 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 LAMB1P07942 1786 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 NPIPB3Q92617 1050 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 CHODLQ9H9P2 273 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 H3BRM9 83 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 ATP5LO75964 103 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 VENTXO95231 258 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 KCNK17Q96T54 332 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 MOSP00540 346 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SFTPCP11686 197 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 HAX1O00165 279 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 EGR1P18146 543 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 ASIPP42127 132 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 POC1AQ8NBT0 407 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 COX6B1P14854 86 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 OR9G1Q8NH87 305 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 TMEM186Q96B77 213 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 IL36BQ9NZH7 164 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 APOMO95445 188 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 PRR33A8MZF0 331 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 FGF5P12034 268 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 IL9P15248 144 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 M0R381 172 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 SYNGR3O43761 229 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 ICAM4Q14773 271 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 IGHV3-48P01763 117 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 Q96M66 194 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 WDR82Q6UXN9 313 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 NRAPQ86VF7 1730 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 Q5BKY6 102 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 AHRRA9YTQ3 701 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGB4-201ENST00000200181 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms