RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-222	ENST00000639482	MRC1	P22897	1456 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	DDB1	Q16531	1140 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	GLI3	P10071	1580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CTAGE5	O15320	804 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCA3	Q99758	1704 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF609	O15014	1411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CLCN6	P51797	869 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TPM4	P67936	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482		E7EWF7	191 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NEMF	O60524	1076 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	STARD3NL	O95772	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	GYS2	P54840	703 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	APP	P05067	770 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PFKFB2	O60825	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	GREM2	Q9H772	168 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A1B0GUL7	405 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	SPTLC2	O15270	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF202	O95125	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	DPF2	Q92785	391 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP5J	P18859	108 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	UBASH3A	P57075	661 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	GSDMD	P57764	484 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	SCARF1	Q14162	830 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CAVIN2	O95810	425 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	FANCC	Q00597	558 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CDC25B	P30305	580 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	PNOC	Q13519	176 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	ITPK1	Q13572	414 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-222	ENST00000639482	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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