RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	STK35	Q8TDR2	534 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	RHOV	Q96L33	236 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	PLVAP	Q9BX97	442 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	DLL1	O00548	723 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ADAM11	O75078	769 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ARL4D	P49703	201 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	AP3B2	Q13367	1082 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SULF2	Q8IWU5	870 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	PHC3	Q8NDX5	983 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	GGT7	Q9UJ14	662 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ARNT	P27540	789 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	RAC1	P63000	192 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	GSTM4	Q03013	218 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	PWP1	Q13610	501 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF394	Q53GI3	561 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	PODN	Q7Z5L7	613 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CTSB	P07858	339 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ELN	P15502	786 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	GART	P22102	1010 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	USP48	Q86UV5	1035 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ECEL1	O95672	775 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	CYP11A1	P05108	521 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	COL8A1	P27658	744 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	LMNB2	Q03252	620 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	POU4F3	Q15319	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	RELL1	Q8IUW5	271 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	KRT82	Q9NSB4	513 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATRX-223	ENST00000637175		F6X3S4	739 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM37	O94972	964 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	WISP1	O95388	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	DLGAP3	O95886	979 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MAOB	P27338	520 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	NLRP12	P59046	1061 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC14	Q15048	493 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	C8orf37	Q96NL8	207 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CORO1B	Q9BR76	489 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF862	O60290	1169 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GREM1	O60565	184 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PF4	P02776	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SELP	P16109	830 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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