RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635231.1

QARS-238, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-238	ENST00000635231	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	PTPN18	Q99952	460 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	CCL15	Q16663	113 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	UTY	O14607	1347 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	VGLL4	Q14135	290 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	MAST3	O60307	1309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.09	□□□□□ -0.31
QARS-238	ENST00000635231	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PDE8B	O95263	885 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	CETP	P11597	493 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	KIF22	Q14807	665 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.08	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	GRIK5	Q16478	980 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PTPRC	P08575	1304 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	BCAM	P50895	628 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	CACNB3	P54284	484 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.06	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	TLR2	O60603	784 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	GNRH1	P01148	92 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PPIL2	Q13356	520 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	SLC5A1	P13866	664 aa		13.04	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PRMT2	P55345	433 aa		13.04	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	PPAT	Q06203	517 aa		13.04	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	LAMB1	P07942	1786 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	EYA2	O00167	538 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	IRF6	O14896	467 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	FGFR2	P21802	821 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	CAP1	Q01518	475 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	LPIN2	Q92539	896 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.03	□□□□□ -0.32
QARS-238	ENST00000635231	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms