RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.44■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SUCLG2Q96I99 432 aa20.44■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.44■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CACNA1FO60840 1977 aa20.43■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANP32CO43423 234 aa20.43■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TNNI2P48788 182 aa20.43■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAP3K9P80192 1104 aa20.42■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.42■□□□□ 0.86
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CSADQ9Y600 493 aa20.42■□□□□ 0.86
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCL15Q16663 113 aa20.41■□□□□ 0.86
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.41■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CACNB3P54284 484 aa20.4■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BRI3BPQ8WY22 251 aa20.4■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OTUD5Q96G74 571 aa20.4■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.4■□□□□ 0.86
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GTF2A2P52657 109 aa20.39■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LRRC24Q50LG9 513 aa20.39■□□□□ 0.85
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CAP1Q01518 475 aa20.38■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGEF6Q15052 776 aa20.38■□□□□ 0.85
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TEKT1Q969V4 418 aa20.38■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARMC5Q96C12 935 aa20.38■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.38■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM43AQ8N2R8 423 aa20.37■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMOD2Q9NZR1 351 aa20.37■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.36■□□□□ 0.85
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PDE8BO95263 885 aa20.35■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.35■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WRNIP1Q96S55 665 aa20.35■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LAMB1P07942 1786 aa20.35■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UTYO14607 1347 aa20.34■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NBPF11Q86T75 865 aa20.34■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.34■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.34■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SPDYE5A6NIY4 337 aa20.33■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CETPP11597 493 aa20.33■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.33■□□□□ 0.85
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.33■□□□□ 0.85
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIF22Q14807 665 aa20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ERO1BQ86YB8 467 aa20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y VGLL2Q8N8G2 317 aa20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HOOK2Q96ED9 719 aa20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF333Q96JL9 665 aa20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.32■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HTTP42858 3142 aa20.31■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.31■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SNAPC2Q13487 334 aa20.31■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MIGA2Q7L4E1 593 aa20.31■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAST3O60307 1309 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BTBD19C9JJ37 291 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IRF6O14896 467 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DCAF15Q66K64 600 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM83AQ86UY5 434 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MRIQ9BWK5 157 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.3■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TLR2O60603 784 aa20.29■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.29■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPIL2Q13356 520 aa20.28■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.28■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.28■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF341Q9BYN7 854 aa20.28■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.28■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTPRCP08575 1304 aa20.27■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC5A1P13866 664 aa20.27■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TCP10Q12799 353 aa20.27■□□□□ 0.84
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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