RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 ELP3Q9H9T3 547 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 ALDH1L1O75891 902 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 ITGA6P23229 1130 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 RASA3Q14644 834 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CCL15Q16663 113 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CSADQ9Y600 493 aa24.19■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 BRCA2P51587 3418 aa24.17■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 GRM8O00222 908 aa24.17■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 KLRK1P26718 216 aa24.17■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 F8W031 263 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 IL1R1P14778 569 aa24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 TNNI2P48788 182 aa24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CHRNDQ07001 517 aa24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CERS5Q8N5B7 392 aa24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.16■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 TLR2O60603 784 aa24.15■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CSF1RP07333 972 aa24.15■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 A0A1W2PPC1 479 aa24.14■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 CETPP11597 493 aa24.14■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K9P80192 1104 aa24.14■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 CAP1Q01518 475 aa24.14■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.14■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 HOXD10P28358 340 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 FOXO4P98177 505 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 HOOK2Q96ED9 719 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 VGLL4Q14135 290 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 CAPN2P17655 700 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 SNAPC2Q13487 334 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 ERO1BQ86YB8 467 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 SUCLG2Q96I99 432 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-208ENST00000608287 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 GJA8P48165 433 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 UBXN2AP68543 259 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 RAET1EQ8TD07 263 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 UTYO14607 1347 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 GJB1P08034 283 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 SHISA4Q96DD7 197 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM47Q96LD4 638 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TEPSINQ96N21 525 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 SRRDQ9UH36 339 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 KIF16BQ96L93 1317 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 A0A1B0GUL6 1792 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TAF5LO75529 589 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 GRK4P32298 578 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 PRO3102Q9H379 93 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 SZT2Q5T011 3432 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 KAZALD1Q96I82 304 aa24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 BTBD19C9JJ37 291 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 PPIL2Q13356 520 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 USP44Q9H0E7 712 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.03■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 PSMC4P43686 418 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 MTFR1Q15390 333 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.02■■□□□ 1.44
SGMS1-208ENST00000608287 RNF208Q9H0X6 261 aa24.02■■□□□ 1.44
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