RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 CCDC102BQ68D86 513 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 WBP1LQ9NX94 342 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 AOX1Q06278 1338 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 RGMBQ6NW40 437 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 TEKT1Q969V4 418 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 TIMM10P62072 90 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 NOGQ13253 232 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 TNFAIP1Q13829 316 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 CEP85Q6P2H3 762 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 XAGE2Q96GT9 111 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 GPR108Q9NPR9 543 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 CLRN2A0PK11 232 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 PDE3AQ14432 1141 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 CCDC102AQ96A19 550 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 AIDAQ96BJ3 306 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 GRM1Q13255 1194 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 RASGRF1Q13972 1273 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 AOC2O75106 756 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 SLC10A3P09131 477 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 VEZTQ9HBM0 779 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 FOXN1O15353 648 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 COG6Q9Y2V7 657 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 DOCK2Q92608 1830 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 PRDX5P30044 214 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 RASA3Q14644 834 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 TNNI3KQ59H18 835 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 MAP3K11Q16584 847 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 CA12O43570 354 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 TNNI2P48788 182 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 GORABQ5T7V8 394 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 MOB2Q70IA6 237 aa21.17■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 UNCXA6NJT0 531 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 FAM83AQ86UY5 434 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 TEPSINQ96N21 525 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.16■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 AK9Q5TCS8 1911 aa21.15■□□□□ 0.98
HERC3-214ENST00000601319 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 GAKO14976 1311 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 FOCADQ5VW36 1801 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 HMMRO75330 724 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 SPATA5Q8NB90 893 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 ZIC5Q96T25 663 aa21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.13■□□□□ 0.97
HERC3-214ENST00000601319 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
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